Le sont des virus appartenant à la famille des et constituent l'une des principales causes des infections des voies respiratoires supérieures chez l'humain [1]. Ces virus à ARN simple brin de polarité positive comptent plus de 160 génotypes identifiés, répartis en trois espèces principales : HRV-A, HRV-B et HRV-C, ce qui explique leur capacité à provoquer des infections répétées [2]. Leur nom provient du grec rhinos, signifiant « nez », reflétant leur tropisme pour les voies nasales, où ils se répliquent de manière optimale à des températures d’environ 33–35 °C [3]. Ils sont responsables de 35 à 50 % des cas de raffroidissement, caractérisés par des symptômes tels que congestion nasale, éternuements, toux et maux de gorge [4]. Bien que généralement bénins, les rinovirus peuvent déclencher des complications graves, notamment des exacerbações d’, de la bronchite aiguë, de la ou de la , en particulier chez les enfants, les personnes âgées et les sujets immunodéprimés [5]. La transmission se fait principalement par contact direct, par gouttelettes respiratoires ou via des surfaces contaminées [6]. L'absence de vaccin, due à la grande diversité des sérums, rend la prévention fondée sur l’hygiène des mains et la désinfection des surfaces [2]. Le diagnostic repose sur des tests moléculaires comme la PCR en temps réel, particulièrement utiles dans les cas de comorbidités respiratoires [8]. Des recherches sont en cours pour développer des antiviraux ciblant des étapes clés du cycle de réplication, comme la protéase 3C ou la polymérase ARN-dépendante, inspirées des succès obtenus avec d'autres virus à ARN comme le [9].
Caractéristiques biologiques et structure du rinovirus
Les sont des virus appartenant à la famille des , caractérisés par une structure simple mais hautement spécialisée qui leur confère une grande capacité infectieuse. Ces virus sont non enveloppés, ce qui signifie qu’ils ne possèdent pas de membrane lipidique externe, ce qui les rend plus résistants aux désinfectants mais plus sensibles à la chaleur [10]. Leur génome est constitué d’un ARN à simple brin de polarité positive, d’une longueur d’environ 7,2 à 7,5 kilobases, encapsulé dans un capside icosaédrique de 30 nanomètres de diamètre [1]. Ce capside est composé de 60 unités répétitives, chacune formée de quatre protéines virales : , , et [10]. Cette structure symétrique assure la protection du matériel génétique et facilite l’attachement aux cellules hôtes.
Structure du virion et génome viral
Le génome viral est traduit directement comme un ARN messager (ARNm) grâce à un élément d’entrée interne du ribosome (IRES) situé dans la région 5’ non traduite, permettant une synthèse rapide des protéines virales même en conditions de stress cellulaire [13]. Une caractéristique distinctive de certains rinovirus est la présence d’une profonde poche hydrophobe dans la protéine , qui sert de site de liaison pour des molécules hôtes ou des antiviraux [14]. Cependant, cette poche n’est pas fonctionnelle chez tous les sérTypes, notamment chez les souches du groupe HRV-C, ce qui limite l’efficacité de certains inhibiteurs comme le pleconaril [15]. Le génome code une polyprotéine précurseur qui est clivée par des protéases virales, notamment la protéase 3C, en protéines structurelles (VP1–VP4) et non structurelles impliquées dans la réplication [13].
Mécanismes d'entrée et de réplication
L’entrée du virus dans la cellule hôte dépend de son interaction avec des récepteurs spécifiques à la surface des cellules épithéliales des voies respiratoires. Environ 90 % des sérTypes des groupes HRV-A et HRV-B utilisent la molécule d’adhésion intercellulaire comme récepteur principal [17]. D'autres sérTypes, notamment certains du groupe HRV-A, se lient au récepteur des lipoprotéines de basse densité [18]. L’interaction avec le récepteur déclenche des réarrangements structuraux du capside, exposant l’extrémité N-terminale de et libérant , ce qui facilite la formation d’un pore dans la membrane endosomiale [19]. Le virus pénètre par endocytose médiée par récepteur, et dans l’endosome acide, le génome viral est libéré dans le cytoplasme par ce pore [20].
Termolabilité et tropisme tissulaire
Une caractéristique biologique clé des rinovirus est leur thermolabilité : ils se répliquent de manière optimale à des températures comprises entre 33 et 35 °C, typiques de l’intérieur du nez, mais leur réplication est réduite à 37 °C, température des voies respiratoires inférieures [21]. Ce tropisme pour les voies respiratoires supérieures explique pourquoi les infections provoquent principalement des symptômes bénins tels que la congestion nasale et les éternuements, contrairement à d'autres virus comme l’ ou le VRS, qui se répliquent efficacement à 37 °C et peuvent causer des maladies plus graves des voies respiratoires inférieures [22]. Cette préférence pour des températures plus basses est également liée à une réponse interféronique atténuée dans les cellules nasales à ces températures, facilitant ainsi l’évasion immunitaire [23].
Distinction avec d'autres virus respiratoires
Les rinovirus se distinguent des autres virus respiratoires par plusieurs caractéristiques : l’absence d’enveloppe, leur grande diversité génétique avec plus de 160 sérTypes identifiés, leur réplication préférentielle à basse température, et leur mécanisme d’entrée cellulaire médié par ou , contrairement au qui utilise le récepteur ou au VRS qui utilise [18]. Leur stabilité sur les surfaces, pouvant durer plusieurs heures, favorise la transmission indirecte par contact avec des objets contaminés [25]. Ces propriétés biologiques et structurales expliquent leur diffusion ubiquitaire, leur capacité à provoquer des réinfections fréquentes, et leur rôle prédominant dans les infections des voies respiratoires supérieures.
Classification et diversité génétique des rinovirus
Les sont classés au sein de la famille des , un groupe de virus à ARN simple brin de polarité positive, et appartiennent désormais officiellement au genre Enterovirus selon les directives du Comité International pour la Tassonomie des Virus (ICTV) [26]. Cette réévaluation taxonomique découle d’analyses phylogénétiques approfondies qui ont révélé une parenté étroite entre les rinovirus et les , conduisant à leur intégration dans un même genre viral [26]. Cette classification repose principalement sur des séquences génomiques conservées, notamment dans les régions codant pour les protéines capsidiques (VP1, VP2, VP3) et la région 5' non traduite (5' UTR), utilisée fréquemment dans les tests diagnostiques moléculaires [28].
Espèces et génotypes des rinovirus
Actuellement, les rinovirus sont divisés en trois espèces principales : HRV-A, HRV-B et HRV-C. Cette classification reflète des différences génétiques significatives et des implications cliniques distinctes. Plus de 170 génotypes distincts ont été identifiés, répartis approximativement comme suit : environ 83 types pour HRV-A, 32 pour HRV-B et au moins 56 pour HRV-C [29]. La découverte d’HRV-C, survenue en 2006 grâce à des techniques de séquençage génomique sans amplification ciblée, explique son identification tardive par rapport aux deux autres espèces, qui étaient historiquement mieux caractérisées [30]. La grande diversité génétique des rinovirus, alimentée par des mutations ponctuelles et des événements de recombinaison entre souches, constitue une des principales raisons de l’absence d’immunité durable et de la fréquence des réinfections [15].
Signification clinique des espèces virales
Les trois espèces de rinovirus présentent des profils de pathogénicité et de gravité clinique différents. HRV-A est généralement associé à des infections plus sévères que HRV-B et est fréquemment impliqué dans les exacerbações de maladies respiratoires chroniques comme l’ et la [1]. Certains sérotypes d’HRV-A sont connus pour provoquer des symptômes plus intenses, notamment un (respiration sifflante) marqué et une durée d’infection prolongée [33]. HRV-B, quant à lui, tend à provoquer des infections plus bénignes et souvent asymptomatiques, avec une implication moindre dans les complications respiratoires graves [1]. HRV-C s’est révélé être le groupe le plus pathogène parmi les rinovirus, fortement associé à des infections respiratoires sévères, en particulier chez les enfants, avec une incidence élevée de , de et d’hospitalisations [35]. HRV-C joue un rôle clé dans les exacerbações aiguës d’asthme et de BPCO, en particulier chez les patients présentant une fonction pulmonaire chroniquement altérée [36]. Sa capacité à se répliquer efficacement dans les voies respiratoires inférieures en fait un agent pathogène d’une importance clinique majeure.
Diagnostic moléculaire et surveillance
Le diagnostic précis de l’espèce de rinovirus repose sur des méthodes moléculaires sensibles, principalement la PCR en temps réel, qui permet d’amplifier et de détecter l’ARN viral à partir d’échantillons cliniques, souvent obtenus par prélèvement nasopharyngé [37]. La région 5' UTR, hautement conservée, est fréquemment ciblée pour la détection initiale. Cependant, la forte similitude génétique entre les rinovirus et les enterovirus peut entraîner des réactions croisées, rendant nécessaire le séquençage génétique pour une classification précise au niveau de l’espèce [8]. En Italie, la surveillance virologique est assurée par le système , géré par l’Istituto Superiore di Sanità (ISS), qui surveille la circulation saisonnière et la diversité génétique des virus respiratoires, y compris les différents génotypes d’HRV-A, HRV-B et HRV-C [39]. Cette surveillance est essentielle pour comprendre les dynamiques épidémiologiques et orienter les stratégies de santé publique.
Symptômes et manifestations cliniques
Les infections par les se manifestent cliniquement par un large éventail de symptômes, allant d'une simple rhinite bénigne à des complications respiratoires graves, en particulier chez les individus vulnérables. La présentation clinique dépend de plusieurs facteurs, notamment l'âge du patient, la présence de comorbidités respiratoires ou immunitaires, ainsi que le génotype viral impliqué [4]. La majorité des infections sont légères et autolimitées, mais elles peuvent avoir un impact significatif sur la qualité de vie et le fonctionnement quotidien.
Symptômes du raffroidissement commun
Le raffroidissement commun, dont les sont la cause la plus fréquente (35 à 50 % des cas), se caractérise par des symptômes des voies respiratoires supérieures. L'incubation est courte, généralement de 12 à 72 heures après l'exposition au virus [2]. Les symptômes typiques incluent :
- Congestion nasale et rinorrhée (nez qui coule), souvent les premiers signes, avec une sécrétion initialement claire qui peut devenir plus épaisse et blanchâtre.
- Éternuements fréquents, particulièrement au début de l'infection.
- Maux de gorge, présents dans environ 60 % des cas.
- Toux sèche, qui peut persister après la résolution des autres symptômes, durant parfois jusqu'à 10-15 jours.
- Malaise général, céphalées et douleurs musculaires légères.
- Fièvre légère, plus fréquente chez les enfants que chez les adultes, où elle est souvent absente ou de bas degré [25].
- Diminution de l'odorat et douleurs faciales, dues à l'inflammation des voies nasales et des sinus paranasaux [43].
La durée moyenne des symptômes est de 7 à 10 jours, mais elle peut s'étendre jusqu'à deux semaines, surtout chez les enfants ou les personnes immunodéprimées [44]. La gravité des symptômes est influencée par la réponse immunitaire individuelle, notamment la rapidité de la réponse des cellules nasales à l'infection [45].
Complications respiratoires
Bien que le raffroidissement commun soit généralement bénin, les peuvent provoquer ou aggraver des affections respiratoires plus graves, en particulier chez les populations à risque. Ces complications soulignent le rôle clinique important de ces virus au-delà d'une simple nuisance.
Exacerbations de l'asthme et de la BPCO
Les sont le principal déclencheur viral des exacerbations d', responsables de 60 à 80 % des épisodes aigus chez les enfants et d'une part importante chez les adultes [46]. L'infection déclenche une inflammation intense des voies respiratoires, aggravant l'hyperactivité bronchique et provoquant des crises de sifflement (wheezing) et de dyspnée. Les patients asthmatiques montrent une réponse altérée de l', ce qui permet une réplication virale plus importante et une inflammation prolongée [47].
De même, dans la , les sont l'un des agents viraux les plus fréquemment isolés lors des riacutisations aiguës [48]. Ces épisodes sont associés à une détérioration de la fonction pulmonaire, une augmentation de la production de mucus et un risque accru d'hospitalisation.
Infections des voies respiratoires inférieures
Chez les jeunes enfants, les personnes âgées et les sujets immunocompromis, les peuvent provoquer des infections des voies respiratoires inférieures :
- Bronchite aiguë : inflammation des bronches, souvent avec une toux persistante.
- Bronchiolite : inflammation des bronchioles, particulièrement fréquente chez les nourrissons et les jeunes enfants, pouvant entraîner des difficultés respiratoires et des hospitalisations [49].
- Pneumonie : bien que moins fréquente que pour d'autres virus, elle peut survenir, surtout en cas de surinfection bactérienne secondaire ou chez les patients immunodéprimés [5].
Facteurs de risque de formes graves
Certaines populations sont particulièrement vulnérables aux formes graves d'infection par les :
- Nourrissons et jeunes enfants : en raison de l'immaturité de leur système immunitaire et de leur première exposition aux virus respiratoires.
- Personnes âgées : en raison du déclin des défenses immunitaires et de la prévalence de comorbidités.
- Patients immunocompromis : en raison de leur défense immunitaire affaiblie.
- Patients atteints de maladies chroniques : comme l', la , les maladies cardiaques ou le diabète, qui augmentent le risque de complications [51].
Différenciation clinique et diagnostique
La distinction entre une infection bénigne et une forme compliquée repose sur une évaluation clinique minutieuse. Le raffroidissement commun se limite aux voies respiratoires supérieures, avec une évolution autolimitée. En revanche, la se manifeste par une détresse respiratoire (tachypnée, utilisation des muscles accessoires), des sifflements et des difficultés à s'alimenter, principalement chez les nourrissons. L'exacerbation de l' se caractérise par une toux, un sifflement et une dyspnée chez un patient ayant des antécédents de la maladie. La est suspectée en cas de fièvre persistante, de dyspnée sévère et de signes radiologiques spécifiques. La connaissance des facteurs de risque permet un meilleur ciblage du diagnostic et de la prise en charge.
Transmission et facteurs de risque
Le rinovirus se transmettent facilement d'une personne à l'autre par plusieurs voies, principalement dans les environnements clos et surpeuplés. La transmission se produit essentiellement par des gouttelettes respiratoires, le contact direct avec des mains ou des sécrétions infectées, ou via des surfaces contaminées [6]. Le virus peut survivre plusieurs heures sur des objets inertes comme les poignées de porte, les téléphones ou les jouets, augmentant ainsi le risque de contamination indirecte [53]. Cette stabilité environnementale est supérieure à celle de certains autres virus respiratoires comme l’, ce qui accentue son potentiel de diffusion [54].
Voies de transmission
La transmission du rinovirus se fait principalement par trois mécanismes. Premièrement, les gouttelettes respiratoires émises lors de la toux, des éternuements ou de la parole peuvent être inhalées par des personnes à proximité ou se déposer sur les muqueuses nasales, oculaires ou buccales [26]. Deuxièmement, la transmission par contact direct, par exemple lors d'une poignée de main avec une personne infectée, permet au virus de passer de la peau contaminée aux muqueuses du nouveau hôte [56]. Enfin, la transmission indirecte par fomites (objets inanimés contaminés) est particulièrement efficace : une personne touche une surface contaminée, puis porte ses mains au visage, permettant ainsi l'entrée du virus par le nez ou la bouche [53]. Des études ont également suggéré une composante de transmission par aérosols, où des particules plus petites (<5 µm) peuvent rester en suspension dans l'air et être inhalées, bien que ce mode soit moins dominant que la transmission par gouttelettes [58].
Période de contagiosité
La période de contagiosité est maximale dans les premiers 2 à 3 jours suivant l'apparition des symptômes, coïncidant avec le pic de charge virale dans les sécrétions nasales [53]. Cependant, le virus peut continuer à être excrété et donc transmissible pendant plusieurs jours après l'atténuation des symptômes, ce qui favorise la propagation silencieuse, notamment chez les enfants ou les sujets immunocompétents [60]. La période d'incubation, c’est-à-dire le temps entre l’exposition au virus et l’apparition des symptômes, est généralement de 12 à 72 heures [2].
Facteurs environnementaux et saisonnalité
La transmission du rinovirus est influencée par des facteurs environnementaux tels que la température et l’humidité. Le virus se réplique de manière optimale à des températures comprises entre 33 et 35 °C, typiques des voies respiratoires supérieures, ce qui explique son tropisme pour le nez [3]. En outre, une faible humidité relative (≤23 %) favorise la survie du virus dans l’air, tandis qu’une humidité plus élevée (>43 %) réduit significativement son infectiosité [63]. La saisonnalité joue également un rôle important : les infections sont plus fréquentes en automne et au printemps, bien que le rinovirus circule toute l’année, parfois même en été, où il peut représenter la majorité des virus respiratoires détectés [64]. Cette circulation précoce ou persistante peut temporairement inhiber celle d'autres virus comme l’ grâce à une interférence virale induite par la réponse immunitaire innée [65].
Populations à risque
Certaines populations sont particulièrement vulnérables aux infections graves ou aux complications dues au rinovirus. Les nourrissons et jeunes enfants, notamment ceux de moins de deux ans, sont les plus touchés en raison de l'immaturité de leur et de leur exposition précoce à des milieux collectifs comme les crèches [66]. Les personnes âgées de plus de 65 ans présentent un risque accru en raison du déclin immunitaire lié à l’âge et de la fréquence des comorbidités [67]. Les sujets immunodéprimés, qu’ils soient atteints d’immunodéficiences primaires, sous traitement immunosuppresseur ou infectés par le VIH, sont également à haut risque d’infections prolongées ou sévères, pouvant évoluer vers une [68]. Enfin, les patients souffrant de maladies chroniques comme l’ ou la BPCO sont particulièrement sensibles aux exacerbações déclenchées par le rinovirus [69].
Facteurs prédisposants aux complications
Plusieurs facteurs augmentent le risque de complications respiratoires inférieures. L’âge extrême, qu’il s’agisse de la petite enfance ou de la vieillesse, est un facteur clé [69]. L’exposition au fumée de tabac passif compromet les défenses naturelles des voies respiratoires et aggrave la susceptibilité aux infections [71]. Un contrôle sous-optimal des maladies chroniques, comme un asthme mal équilibré, augmente également le risque d’exacerbation virale [72]. Enfin, les environnements surpeuplés comme les écoles, les maisons de retraite ou les hôpitaux facilitent la transmission du virus [73].
Prévention de la transmission
La prévention repose sur des mesures d’hygiène simples mais essentielles. Le lavage fréquent des mains à l’eau et au savon ou l’utilisation de solutions hydroalcooliques réduit considérablement le risque de transmission par contact [2]. Il est également crucial d’éviter de se toucher les yeux, le nez ou la bouche avec des mains non lavées. L’utilisation d’un mouchoir ou du coude pour tousser ou éternuer permet de limiter la dispersion des gouttelettes infectieuses [75]. La désinfection régulière des surfaces fréquemment touchées, comme les poignées ou les claviers, est recommandée, surtout en période de forte circulation virale [76]. Enfin, maintenir une distance physique avec les personnes malades, en particulier dans les espaces clos, contribue à réduire la transmission [77]. Bien qu’aucun ne soit disponible en raison de la grande diversité des sérums, ces mesures comportementales restent les piliers de la prévention [2].
Complications et rôle dans les maladies respiratoires chroniques
Les sont généralement responsables de formes bénignes d’infection des voies respiratoires supérieures, comme le raffroidissement, mais ils peuvent provoquer des complications graves, en particulier chez les individus vulnérables. Ces complications incluent des exacerbações d’affections respiratoires chroniques telles que l’ et la bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO), ainsi que des infections des voies respiratoires inférieures comme la bronchite aiguë, la et la [5]. Ces complications sont particulièrement fréquentes chez les enfants, les personnes âgées et les sujets immunodéprimés, chez lesquels les défenses immunitaires sont affaiblies ou immatures [4].
Rôle dans les exacerbações d’asthme
Les rinovirus sont le principal déclencheur viral des exacerbações d’, en particulier chez les enfants. Des études épidémiologiques indiquent que plus de 80 % des exacerbações asthmatiques pédiatriques sont associées à des infections virales, dont environ 60 à 80 % sont causées par des rinovirus [46]. L’infection par un rinovirus provoque une inflammation des voies respiratoires, une hyperactivité bronchique et une obstruction, aggravant ainsi le contrôle de l’asthme. Ce risque est particulièrement élevé lorsque l’infection se produit chez un enfant déjà sensibilisé à des allergènes, car la double exposition amplifie la réponse inflammatoire des voies aériennes [46].
Les infections répétées par le rinovirus, notamment le rinovirus C (RV-C), durant la petite enfance sont associées à un risque accru de développer un asthme persistant à l’âge pédiatrique [83]. Un suivi sur un an après une bronchiolite à rinovirus a montré une forte incidence de sifflements respiratoires récurrents, suggérant un lien entre l’infection précoce et l’instabilité des voies respiratoires [84]. Les lignes directrices GINA (Global Initiative for Asthma) reconnaissent explicitement le rôle central des rinovirus comme facteur déclenchant des exacerbações asthmatiques [85].
Rôle dans les exacerbações de BPCO
Dans la , les rinovirus sont parmi les agents pathogènes viraux les plus fréquemment isolés lors des exacerbações aiguës, aux côtés des virus grippaux et du virus respiratoire syncytial (VRS) [48]. Ces infections sont associées à une aggravation significative de la dyspnée, de la toux et de la production d’expectorations. Les exacerbações virales, notamment celles causées par les rinovirus, peuvent entraîner des complications graves telles que l’insuffisance respiratoire aiguë et le recours à l’hospitalisation [87]. La gestion clinique repose sur une évaluation rapide de la fonction respiratoire par spirométrie, de la saturation en oxygène et des gaz du sang pour évaluer l’étendue du dommage fonctionnel [88].
Mécanismes immunopathogéniques
Les mécanismes à l’origine des exacerbações provoquées par les rinovirus chez les patients asthmatiques ou atteints de BPCO sont complexes et impliquent des altérations de la réponse immunitaire innée et adaptative. Les cellules épithéliales des voies respiratoires, principales cibles du virus, présentent chez ces patients une réponse antivirale innée compromise, avec une production réduite d’interférons de type I (IFN-β) et de type III (IFN-λ) [47]. Cette carence empêche un contrôle efficace de la réplication virale, favorisant une charge virale plus élevée et une infection plus prolongée.
En parallèle, les cellules épithéliales infectées libèrent des cytokines d’alerte telles que l’IL-25, l’IL-33 et la thymic stromal lymphopoietin (TSLP), qui activent les cellules lymphoïdes innées de type 2 (ILC2) [47]. Ces cellules induisent une réponse inflammatoire de type Th2, caractérisée par la production d’IL-4, d’IL-5 et d’IL-13, des médiateurs clés de l’inflammation éosinophile, de l’hyperactivité bronchique et de la production de mucus. Le rinovirus peut également échapper au système immunitaire en induisant l’expression de molécules immunosuppressives comme PD-1, conduisant à une réponse immunitaire inefficace [91].
Facteurs de risque et populations vulnérables
Les populations les plus à risque d’infections graves à rinovirus incluent les nourrissons et les jeunes enfants (surtout ceux de moins de deux ans), les personnes âgées de plus de 65 ans et les sujets immunodéprimés [66]. Les enfants sont particulièrement vulnérables en raison de l’immaturité de leur système immunitaire et de leur exposition fréquente à des environnements collectifs comme les crèches [93]. Les personnes âgées, quant à elles, voient leur système immunitaire affaibli avec l’âge, ce qui augmente leur susceptibilité aux infections graves [67].
Les affections chroniques préexistantes, telles que l’asthme, la BPCO, les maladies cardiaques ou le diabète, augmentent considérablement le risque de complications respiratoires [95]. L’exposition au tabagisme passif et un contrôle sous-optimal des maladies chroniques sont également des facteurs prédisposants majeurs [71].
Impact épidémiologique et charge sanitaire
Les rinovirus contribuent de manière significative à la charge sanitaire des maladies respiratoires chroniques. Dans l’asthme, ils aggravent le contrôle de la maladie, augmentent la nécessité de traitements intensifs (comme les corticoïdes systémiques) et augmentent le risque d’hospitalisation [97]. Dans la BPCO, ils sont associés à une accélération du déclin de la fonction pulmonaire, à une augmentation de la morbidité et à des coûts de santé élevés [98]. Le système de surveillance intégrée RespiVirNet en Italie a montré que les rinovirus constituent environ la moitié des virus respiratoires identifiés, soulignant leur rôle prédominant dans les infections respiratoires aiguës [99]. Cette surveillance est essentielle pour orienter les politiques de prévention et de gestion clinique.
Diagnostic virologique et surveillance épidémiologique
Le diagnostic virologique des infections à repose principalement sur des techniques moléculaires hautement sensibles, en particulier la PCR en temps réel (RT-PCR), qui permet la détection spécifique de l’ARN viral à partir de prélèvements nasopharyngés [37]. Cette méthode est considérée comme la référence en laboratoire en raison de sa sensibilité et de sa spécificité élevées, souvent supérieures à 95 %, ce qui permet d’identifier le virus même en cas de faible charge virale ou d’infection asymptomatique [37]. La RT-PCR cible généralement la région 5' non traduite (5' UTR) du génome viral, qui est fortement conservée parmi les différents génotypes, facilitant ainsi la détection croisée [102]. Cependant, cette conservation entraîne une réactivité croisée fréquente avec les entérovirus, rendant parfois nécessaire un séquençage génétique pour une identification précise au niveau des espèces HRV-A, HRV-B ou HRV-C [8].
Méthodes diagnostiques et contextes cliniques
La coltura virale, bien que spécifique, est peu utilisée en pratique clinique en raison de sa faible sensibilité et de son temps d’obtention des résultats long (jusqu’à 7-10 jours), car les rinovirus sont difficiles à cultiver in vitro [104]. Les tests antigéniques rapides, quant à eux, manquent de sensibilité et ne sont pas recommandés pour le diagnostic du rinovirus [105]. En revanche, les panneaux multiplex de PCR sont devenus des outils essentiels dans les contextes cliniques complexes, car ils permettent de détecter simultanément jusqu’à 18 virus respiratoires (y compris , , VRS et adenovirus) à partir d’un seul échantillon [106]. Ces tests sont particulièrement utiles pour le diagnostic différentiel en période épidémique ou en milieu hospitalier [107].
Le diagnostic moléculaire par PCR, bien que non nécessaire pour les rhumes bénins, est crucial dans plusieurs situations cliniques :
- Pour confirmer le rôle du rinovirus dans les exacerbations d’, notamment chez les enfants, où il est impliqué dans 60 à 80 % des cas [108].
- Dans la gestion des riacutisations de la BPCO, où il aide à distinguer les causes virales des causes bactériennes et à éviter une antibiothérapie inappropriée [109].
- Pour le suivi des infections chez les patients immunocompromis ou atteints de maladies respiratoires chroniques, où le rinovirus peut provoquer des infections des voies respiratoires inférieures telles que la bronchite ou la [110].
Surveillance épidémiologique et systèmes de suivi
La surveillance épidémiologique des rinovirus est intégrée dans des réseaux nationaux et internationaux de surveillance des virus respiratoires. En Italie, le système RespiVirNet, coordonné par l’Institut supérieur de la santé (ISS) et le ministère de la Santé, surveille hebdomadairement la circulation des virus respiratoires, y compris le rinovirus, à partir de données cliniques fournies par des médecins généralistes et pédiatres, ainsi que d’analyses virologiques réalisées par des laboratoires de référence régionaux [39]. Ce système permet de suivre l’incidence des infections respiratoires aiguës (IRA), d’identifier les génotypes circulants et de publier des rapports hebdomadaires (RespiNews) pour informer la population et orienter les politiques de santé publique [112].
À l’échelle mondiale, bien qu’il n’existe pas de système centralisé dédié exclusivement au rinovirus géré par l’OMS, sa circulation est surveillée indirectement par des réseaux comme le National Respiratory and Enteric Virus Surveillance System (NREVSS) aux États-Unis ou le programme de surveillance mondiale du Département de la Défense américain [113]. L’analyse des eaux usées a également émergé comme une méthode puissante de surveillance environnementale, permettant de détecter la prévalence et la diversité génétique du rinovirus, même en l’absence de symptômes cliniques [114].
Modélisation mathématique et prévision des épidémies
Les données de surveillance sont intégrées dans des modèles mathématiques pour prédire les épidémies de rinovirus et orienter les politiques sanitaires. Le modèle SIR (Suscettibili–Infetti–Risolti) et sa variante SEIR (Suscettibili–Esposti–Infetti–Risolti) simulent la dynamique de transmission dans les populations en estimant des paramètres clés comme le nombre de reproduction de base (R0) ou le taux de reproduction effectif (Rt) [115]. Ces modèles aident à anticiper les pics épidémiques, à évaluer l’impact des mesures de prévention (comme le lavage des mains ou la ventilation des espaces clos) et à optimiser la gestion des ressources sanitaires, notamment en période de co-circulation avec d’autres virus respiratoires comme l’influenza ou le SARS-CoV-2 [116]. Des projets comme Influcast développent des algorithmes prédictifs pour évaluer l’impact des épidémies sur le système de santé [117].
La surveillance intégrée, combinée à la modélisation, est essentielle pour comprendre la stagnation saisonnière du rinovirus, qui circule principalement en automne et au printemps, avec une présence significative toute l’année, souvent dépassant en prévalence d’autres virus respiratoires [64]. Ces données sont cruciales pour la prévention, notamment chez les populations vulnérables comme les jeunes enfants, où le rinovirus est associé à un risque accru de et de développement d’ persistant [83].
Traitement et approches thérapeutiques en développement
À ce jour, aucun traitement antiviral spécifique ni vaccin n’a été approuvé pour prévenir ou traiter les infections à , en raison de la grande diversité génétique du virus, qui compte plus de 160 sérétypes identifiés [2]. Par conséquent, la prise en charge clinique repose exclusivement sur une approche symptomatique, visant à soulager les manifestations du raffroidissement commun. Les recommandations incluent le repos, une hydratation adéquate, l’utilisation d’antipyrétiques ou d’analgésiques comme le paracétamol ou l’ibuprofène pour réduire la fièvre et les douleurs, ainsi que l’application de décongestionnants nasaux ou de sprays à base de solution saline pour atténuer la congestion [121]. L’humidification de l’air ambiant peut également aider à faciliter la respiration [122]. Il est essentiel de noter que les sont inefficaces contre les rinovirus, car il s’agit d’un agent viral, et ne doivent être prescrits qu’en cas de surinfection bactérienne secondaire [123]. Dans certains cas, la prise précoce de peut contribuer à réduire la durée et la gravité des symptômes, bien que les données restent limitées [121].
Défis dans le développement d'antiviraux spécifiques
Le principal obstacle au développement de traitements antiviraux efficaces contre les rinovirus est leur élevée variabilité génétique. Le virus possède un génome à ARN simple brin de polarité positive, répliqué par une polymérase virale dépourvue de fonction de correction (proofreading), ce qui entraîne un taux de mutation élevé et une évolution rapide [125]. Cette plasticité génétique complique la conception de médicaments ciblant des protéines virales spécifiques, car les mutations peuvent rapidement conférer une résistance. De plus, les nombreux sérétypes, répartis en trois espèces principales (HRV-A, HRV-B, HRV-C), présentent des différences structurales, notamment dans les protéines de capside, ce qui rend difficile la création d’un traitement universel [26]. D’autres défis incluent des problèmes de pharmacocinétique, comme une biodisponibilité orale insuffisante ou une difficulté à atteindre des concentrations thérapeutiques dans les voies respiratoires supérieures, ainsi que des préoccupations de toxicité, comme des effets secondaires ou des interactions médicamenteuses [125]. Des candidats prometteurs comme le pleconaril, un stabilisateur de capside, ou le rupintrivir, un inhibiteur de la , ont échoué dans les essais cliniques en raison de ces limitations [128].
Stratégies thérapeutiques innovantes en développement
Malgré ces défis, la recherche explore activement plusieurs voies prometteuses pour développer des thérapies efficaces. Une approche majeure consiste à cibler des épitopes conservés ou des protéines virales essentielles qui varient peu entre les sérétypes. La protéase 3C est un candidat de choix, car elle est cruciale pour le clivage de la polyprotéine virale en protéines fonctionnelles et présente un site actif hautement conservé [129]. Des inhibiteurs non covalents de cette enzyme ont montré une activité antivirale in vitro. Un autre cible est la polymérase ARN-dépendante (3Dpol ou RdRp), responsable de la réplication du génome viral, qui est également fortement conservée parmi les picornavirus [130]. L’inspiration vient des succès obtenus avec d'autres virus à ARN, comme le , où des inhibiteurs de la polymérase (remdesivir) ou de la protéase (nirmatrelvir) ont été développés [131].
Des stratégies plus innovantes incluent le ciblage direct de l’ARN viral lui-même, par exemple à l’aide d’oligonucléotides antisens ou de siRNA conçus pour se lier à des régions structurées et conservées du génome, comme l’élément d’entrée interne du ribosome (IRES), afin de bloquer la traduction ou la réplication [132]. Une autre piste prometteuse est le développement d’anticorps monoclonaux capables de neutraliser plusieurs sérétypes, en s’inspirant du succès du nirsevimab contre le chez les nourrissons [133]. Enfin, les approches de ciblage de l’hôte (host-targeting), qui visent des facteurs cellulaires essentiels à la réplication virale, comme certaines kinases ou la protéine STING, offrent un large spectre d’action et un risque réduit de résistance virale [134].
Modulation de la réponse immunitaire
Une autre voie de recherche vise à moduler la réponse immunitaire de l’hôte pour prévenir les exacerbatations respiratoires. Chez les patients asthmatiques ou atteints de , la réponse immunitaire innée est souvent altérée, avec une production insuffisante d’, ce qui permet une réplication virale plus importante [125]. L’administration d’interférons exogènes, comme l’interféron bêta inhalé, a été testée, mais avec des résultats cliniques mitigés, probablement en raison d’un retard dans la prise en charge [125]. Des études explorent également l’utilisation d’agents biologiques ciblant les cytokines pro-inflammatoires (comme IL-33, TSLP ou IL-4Rα) qui sont surexprimées lors de l’infection et contribuent à l’hyper-réactivité bronchique. Par exemple, le tézépéllumab, un anticorps anti-TSLP, a montré une réduction des exacerbations virales dans l’asthme sévère, suggérant un potentiel pour protéger les patients à haut risque [125].
Prévention et gestion des infections
La prévention et la gestion des infections à reposent principalement sur des mesures non pharmacologiques, car aucun vaccin ni traitement antiviral spécifique n'est actuellement disponible [2]. En raison de la grande diversité génétique du virus — plus de 160 sérétypes identifiés —, le développement d’un vaccin universel reste un défi majeur pour la recherche [125]. Par conséquent, les stratégies de prévention sont centrées sur l’hygiène individuelle et environnementale, tandis que la gestion clinique se concentre sur le soulagement des symptômes.
Prévention par l’hygiène et les mesures comportementales
Les mesures d’hygiène sont les piliers de la prévention des infections à rinovirus. Le virus se transmet principalement par contact direct avec des mains contaminées, par inhalation de gouttelettes respiratoires émises lors de toux ou d’éternuements, ou par contact avec des surfaces porteuses du virus [6]. Le rinovirus peut survivre plusieurs heures, voire plusieurs jours, sur des surfaces inertes comme les poignées de porte, les téléphones ou les jouets, augmentant ainsi le risque de transmission indirecte [25].
Les pratiques préventives essentielles incluent :
- Le lavage fréquent des mains à l’eau et au savon, ou l’utilisation de solutions hydroalcooliques [2].
- L’évitement de se toucher les yeux, le nez ou la bouche avec des mains non lavées, afin de prévenir l’auto-inoculation virale [2].
- La couverture de la bouche et du nez lors de toux ou d’éternuements, de préférence avec le coude ou un mouchoir jetable [75].
- La désinfection régulière des surfaces fréquemment touchées, notamment dans les lieux collectifs comme les écoles, les garderies ou les bureaux [2].
Dans les contextes à risque élevé, tels que les établissements de santé ou les maisons de retraite, des mesures supplémentaires comme l’isolement des personnes symptomatiques et l’aération des espaces clos sont recommandées pour limiter la propagation [146].
Gestion clinique et traitement symptomatique
Étant donné l’absence de traitement antiviral approuvé, la prise en charge des infections à rinovirus est exclusivement symptomatique [121]. Les recommandations thérapeutiques visent à soulager les symptômes, soutenir le système immunitaire et prévenir les complications, en particulier chez les personnes vulnérables.
Les mesures de gestion comprennent :
- Le repos et une hydratation adéquate, essentiels pour faciliter la récupération et maintenir la clairance muqueuse [148].
- L’utilisation d’antipyrétiques et d’analgesiques tels que le paracétamol ou l’ibuprofène pour réduire la fièvre, les maux de tête et les douleurs musculaires [148].
- L’application de décongestionnants nasaux ou de sprays à base de solution saline pour atténuer la congestion et la rhinorrhée [150].
- L’humidification de l’air ambiant, qui peut aider à fluidifier les sécrétions et à réduire l’irritation des voies respiratoires supérieures [122].
Il est crucial de rappeler que les ne sont pas efficaces contre les infections virales, y compris celles causées par le rinovirus, et ne doivent être utilisés que dans le cas d’une surinfection bactérienne secondaire confirmée [123]. Leur utilisation inappropriée contribue à l’émergence de la résistance aux antibiotiques, un enjeu majeur de santé publique.
Certaines études suggèrent que la supplémentation précoce en pourrait réduire la durée et la gravité des symptômes, bien que les preuves restent mitigées et que les effets secondaires (comme les troubles du goût ou des nausées) doivent être pris en compte [121].
Stratégies de prévention ciblées pour les populations à risque
Les personnes âgées, les jeunes enfants, les patients atteints de maladies chroniques comme l’, la BPCO, ou les sujets immunodéprimés sont particulièrement vulnérables aux complications des infections à rinovirus, notamment les exacerbações d’asthme, la bronchite aiguë, la bronchiolite ou la pneumonie [69]. Chez ces individus, le rinovirus peut provoquer une inflammation des voies aériennes amplifiée et une détérioration fonctionnelle respiratoire.
Pour ces groupes à risque, la prévention repose sur :
- Un contrôle optimal de la maladie de fond (par exemple, l’usage régulier de corticoïdes inhalés pour l’asthme ou la BPCO) [97].
- La vaccination annuelle contre l’ et les infections à pneumocoque, qui, bien qu’elles ne protègent pas contre le rinovirus, réduisent le risque de coinfections et de complications respiratoires sévères [2].
- L’évitement des expositions au tabagisme passif, qui compromet les défenses des voies respiratoires et augmente la susceptibilité aux infections virales [71].
- La surveillance précoce des symptômes, permettant une intervention rapide en cas d’exacerbation (par exemple, augmentation de la thérapie bronchodilatatrice ou initiation de corticoïdes oraux) [158].
Recherche en cours et perspectives thérapeutiques
Malgré l’absence de traitements spécifiques, la recherche explore activement plusieurs pistes prometteuses. Parmi les cibles moléculaires les plus étudiées figurent la protéase 3C, essentielle au clivage des poliprotéines virales, et la polymérase ARN-dépendante, responsable de la réplication du génome viral [129]. Des inibiteurs de ces enzymes, inspirés des succès obtenus avec d’autres virus à ARN comme le , sont en cours d’évaluation [9].
D’autres approches innovantes incluent :
- Le développement de vaccins multivallents ou multiepitopiques, conçus pour induire une réponse immunitaire T et humorale contre plusieurs sérétypes [161].
- L’utilisation d’anticorps monoclonaux ciblant des épitopes conservés du virus, notamment chez les patients immunodéprimés [162].
- Des stratégies d’interférence par ARN (siRNA) ou d’oligonucléotides antisens visant directement le génome viral [132].
En outre, des approches ciblant l’hôte, comme l’inhibition de la dihydroorotate déshydrogénase humaine (hDHODH), montrent une activité antivirale large, potentiellement efficace contre plusieurs virus respiratoires, y compris le rinovirus [164].
La gestion des infections à rinovirus reste donc un domaine où la prévention, fondée sur des mesures simples mais rigoureuses, joue un rôle central. L’amélioration de la prise en charge dépendra de progrès significatifs dans la compréhension des mécanismes d’évasion immunitaire et dans le développement de traitements capables de surmonter la diversité génétique exceptionnelle de ce virus.